Ed Elric (Ryôsuke Yamada) wurde ein staatlicher Alchemist und machte sich zusammen mit seinem Bruder Alphonse (Atom Mizuishi) auf die Suche nach dem Stein der Weisen, der es ihm theoretisch ermöglichen würde, ihre Mutter wiederzubeleben und ihren Körper zurückzuholen. Die Brüder Elric stellen jedoch bald fest, dass sie nicht die einzigen sind, die den Stein in die Finger bekommen wollen. Scar (Mackenyu) greift die Alchemisten an. Er arbeitet für die staatliche Armee von Amestris, einem Land, das im letzten Bürgerkrieg dezimiert wurde.